1抑酸药与胃粘膜保护药（秘剂和硫糖铝）合用
抑酸药是目前治疗消化系统尤其是消化溃疡的常用药物，包括H2-受体阻断剂如西咪替丁、雷尼替丁、法莫替丁等和质子泵抑制剂（PPI）如奥美拉挫、兰索拉唑、泮托拉唑等。
本类药物主要抑制酸的制造和分泌或对进入胃囊的H离子进行中和而使胃内pH值升高，而泌剂和枸橼酸泌钾，胶体果胶铋需在胃酸的条件下形成保护层覆盖于溃疡面上，阻止胃酸、酶及食物对溃疡的侵袭，促进粘膜再生和溃疡愈合。硫糖铝也需在酸性环境下才能发挥粘膜保护作用。临床为缓解溃疡疼痛而合用抑酸药时，需在口服胃粘膜保护药半小时或1小时后再服用。
2胃蛋白酶与抗酸药合用
胃蛋白酶在酸性环境中作用増强，在碱性溶液中易破坏、失效。
抑酸药物为碱性物质，同理抑酸药物因抑制酸的制造和分泌而使胃内pH值升高，因此胃蛋白酶及其复方制剂不与抑酸、抗酸药物合用。
3乳酶生不宜与抗菌药、抗酸药及吸附剂合用
因乳酶生为活的乳酸菌的干燥剂，在肠内分漏类生成乳酸，使肠内酸度升高，从而抑制肠内病原体繁殖。因此不与抑酸药及吸附剂合用，以防降低疗效。
原则上不与抗生素合用，若需应用抗生素以控制严重感染，可错开服药时间，或考虑用死菌制剂如嗜酸杆菌制剂、乳酸菌素等。该类药物不受抗生素影响，因此用上类药需间隔2-3小时尚可。
4胰酶及其制剂与抗酸药合用
胰酶在中性或微碱性时效力最好。多与碳酸氧钠同服。口服不宜咬碎，防胃酸破坏。不与胃酸药合用。
5双面蒙脱石与抗生素合用
口服蒙脱石后，可均匀地覆盖在整个胃肠腔表面，吸附多种病原体，将其固定在肠腔表面而后随肠蠕动排出体外，同时减少肠细胞的运动失调，恢复肠蠕动的正常节律。为目前治疗各种急慢性腹泻的常用药物。
若同服抗生素，则蒙脱石在肠道形成保护膜与同服的抗生素可吸附而随粪便排出体外，而使抗生素失效。应在口服抗生素1-2小时后再服用蒙脱石。
6胃肠动力药与解癌药合用
在治疗消化不良伴腹痛、恶心呕吐时，常将胃动力药与解痉药合用。胃动力药主要有多巴胺受体拮抗剂和5-HT4受体激动剂如西沙必利、莫沙必利，两者分别増强乙酰胆碱的兴奋作用或促进乙酰胆碱释放而发挥促动力作用。
而解痉药以抗胆碱药物为主如阿托品、-2，两者药理作用拮抗，不宜合用。
7柳氮磺胺吡啶与抗生素合用
柳氮磺胺吡啶是溃疡性结肠炎的常用药物，但该类患者常有脓血便，治疗常给予抗生素控制感染。
而柳氮磺胺吡啶在肠内经细菌分解成横胺吡啶和5-ASA抑制剂。该药作用机制是通过5-ASA抑制前列素合成而发挥抗感染作用。若同时服用抗生素将破坏肠道菌群，使细菌数虽减少，影响药物分解，降低疗效。
8喹诺酮类药合用抗酸药治疗肠道感染
肠道细菌感染时，往往用抗生素进行治疗。而喹诺酮类药对G+、G-均有明显作用，为肠道感染首选口服药物。
肠道感染往往有恶心呕吐症状，易损伤胃肠粘膜，临床常合用胃肠粘膜保护药，以其缓解胃部不适，胃粘膜保护药含铋及铝，而喹诺酮药因与多价金属离子发生络合反应，使药物吸收减少，血药浓度下降，降低药物疗效。但可错开时间服用，先服用粘膜保护药为佳。
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