但临床上有时很多表现为扁桃体“发炎”的疾病误诊为化脓性扁桃体炎的，造成一定程度声的抗生素的滥用。作为儿科医生，必须仔细鉴别。
首先需要鉴别的是病原体，也就是病毒性扁桃体炎。急性病毒性扁桃体炎患儿扁桃体多表现为红肿充血，滤泡增生，双侧颊粘膜多见充血，甚至可看到出血点，但粘膜是光滑的（与麻疹粘膜斑不同）；软腭或咽喉壁有时可见小的溃疡，扁桃体表面有时可见小的白色斑点渗出物。另外，病毒性扁桃体炎患儿血常规白细胞多数正常或轻度升高，分类以淋巴为主，CRP及降钙素原基本正常或轻度升高。
其次，儿科医生还必须将化脓性扁桃体炎与其他以扁桃体“发炎”为伴随症状的相关疾病进行鉴别，这里主要介绍一下几种：
、EB病毒相关传染性单核细胞增多症：血常规白细胞升高，但是以淋巴细胞为主，CRP多为正常或轻微升高；扁桃体上的为白色膜状物。具体鉴别可参考本